Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Spta1P08032 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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