Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms