Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ccl20O89093 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Ccl20O89093 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ccl20O89093 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ccl20O89093 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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