Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a20bO88575 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a20bO88575 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms