Protein–RNA interactions for Protein: O88574

Sap30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30O88574 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sap30O88574 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sap30O88574 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Sap30O88574 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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