Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cfdp1O88271 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cfdp1O88271 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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