Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ptpn20O55082 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms