Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms