Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
E2f6O54917 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
E2f6O54917 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms