Protein–RNA interactions for Protein: O54828

Rgs9, Regulator of G-protein signaling 9, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rgs9O54828 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rgs9O54828 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms