Protein–RNA interactions for Protein: O35864

Cops5, COP9 signalosome complex subunit 5, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops5O35864 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cops5O35864 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cops5O35864 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cops5O35864 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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