Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Opn1mwO35599 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Opn1mwO35599 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms