Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1aO35526 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms