Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
TnxbO35452 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
TnxbO35452 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms