Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Prrt1O35449 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Prrt1O35449 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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