Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms