Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ArxO35085 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ArxO35085 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ArxO35085 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ArxO35085 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms