Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp35M0QWN7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp35M0QWN7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms