Protein–RNA interactions for Protein: L7N248

Gm6871, Predicted gene 6871, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6871L7N248 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm6871L7N248 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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