Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm21310J3QQ23 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms