Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Rps8-ps2-201ENSMUST00000118709 624 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm14438-201ENSMUST00000121572 624 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Resp18-201ENSMUST00000039534 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Gm43544-201ENSMUST00000196474 2472 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Tmprss11c-201ENSMUST00000059424 1615 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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