Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms