Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Fam240aJ3QNP9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Fam240aJ3QNP9 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam240aJ3QNP9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam240aJ3QNP9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam240aJ3QNP9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam240aJ3QNP9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam240aJ3QNP9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Fam240aJ3QNP9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam240aJ3QNP9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Fam240aJ3QNP9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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