Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Smim18J3QNP2 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms