Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
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