Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930544D05RikJ3QK56 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms