Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm21818J3KMS6 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms