Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI0

Gm20815, Predicted gene, 20815, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20815J3KMI0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm20815J3KMI0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms