Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Usp17ldG5E8G2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms