Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf148G3X9R7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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