Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
2610008E11RikG3X964 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms