Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2-M1F7CXU4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms