Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm28038F7BCN9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm28038F7BCN9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm28038F7BCN9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm28038F7BCN9 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm28038F7BCN9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm28038F7BCN9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm28038F7BCN9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Gm28038F7BCN9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm28038F7BCN9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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