Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm28048F7BCN0 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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