Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Igkv1-99F6XWB2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms