Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm10378F6XQQ1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm10378F6XQQ1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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