Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Zfp988F6VKC7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp988F6VKC7 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp988F6VKC7 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp988F6VKC7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Zfp988F6VKC7 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Zfp988F6VKC7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Zfp988F6VKC7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Zfp988F6VKC7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp988F6VKC7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp988F6VKC7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp988F6VKC7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp988F6VKC7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Zfp988F6VKC7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
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