Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pagr1bF6V0H0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms