Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm17555F6U8B9 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm17555F6U8B9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms