Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm20518E9Q548 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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