Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms