Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms