Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Fndc1E9Q043 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fndc1E9Q043 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms