Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20425E9Q035 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20425E9Q035 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms