Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Brd1E9PZ26 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Brd1E9PZ26 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms