Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trappc8E9PWG2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Trappc8E9PWG2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms