Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clca3bE9PUL3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clca3bE9PUL3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms