Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clip3B9EHT4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clip3B9EHT4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Clip3B9EHT4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Clip3B9EHT4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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