Protein–RNA interactions for Protein: B2RW11

Ankrd34a, Ankyrin repeat domain 34A, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd34aB2RW11 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ankrd34aB2RW11 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ankrd34aB2RW11 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms