Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Clrn2B2RVW2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Clrn2B2RVW2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms